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本科為國內兒童醫療機構中首先成立之兒童呼吸胸腔專科，且將軟式支氣管鏡檢查例行性應用於兒科病人，自民國82年至今，本科已完成超過三千例之檢查。近年來，更將肺泡灌洗術應用於免疫不全及不明原因性肺浸潤之病童，對其病灶之致病原因有莫大之助益。本科對睡眠呼吸障礙的研究也是領先國內，為國內兒童胸腔醫學之先鋒。此外本科對兒童肺結核及兒童肺炎與肋膜積水之研究亦相當傑出。
本科之臨床服務範圍包含各類兒童呼吸胸腔之疾病諸如：肺炎、肋膜積水、膿胸、咳血、哮喘、氣喘、肺結核、呼吸道異常、慢性咳嗽及睡眠等障礙及呼吸道之功能檢查，諸如：兒童軟式支氣管鏡檢查、肺泡沖洗術檢查及胸腔超音波檢查等。

1.服務範圍為胸腔呼吸道感染(諸如肺炎、氣管炎、肺結核、膿胸等)或胸腔呼吸道之異常(如先天性氣道異常、氣喘、不明原因之咳嗽、不明原因之喘鳴、氣胸、肋膜積水、咳血、睡眠障礙等)。
2.本科為國內最具規模的兒童氣管鏡檢查中心之一，年服務量約250~300件。舉凡氣道異常、長期反覆之喘鳴或吵雜呼吸聲、不明原因性之肺浸潤或肺塌陷，或疑異物嗆入皆為接受氣管鏡檢查之適應症。本科另有肺功能檢查與胸腔超音波檢查提供病童全面性的照護。
3.本科與新生兒科合作提供睡眠障礙病童完整的睡眠監測檢查與食道逆流檢查。